Nancy Choudhary

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Forschungsübersicht

Ich arbeite daran, die biochemischen Wege der Withanolid-Biosynthese in Nachtschattenpflanzen aufzuklären. Anschließend interessiere ich mich besonders für die Untersuchung der Evolution der Gene der Withanolid-Biosynthese und ihrer strukturellen Diversifizierung. Hierfür verwende ich Long-Read-Sequenzierung, um Genomsequenzen zu generieren. Methoden wie BLAST, Syntenieanalyse, Co-Expressionsanalyse und phylogenetische Analyse werden verwendet, um Genkandidaten zu identifizieren. Die "Datenwiederverwendung" unter Verwendung öffentlich verfügbarer genomischer und transkriptomischer Sequenzen sowie das "öffentliche Teilen" sind wichtige Bestandteile meiner Arbeitsprinzipien.

Qualifikationen

• 2023-heute: Doktorand, TU Braunschweig
• 2021-2023: M.Tech in Biotechnologie, IIT Mandi, Indien
• 2017-2021: B.Tech in Biotechnologie, Kurukshetra University, Indien

Veröffentlichungen

• Hakim S.E.*, Choudhary N.*, Malhotra K.*, Peng J.*, Arafa A., Bültemeier A., Friedhoff R., Bauer M., Witte C.-P., Herde M., Heretsch P., Pucker B., Franke J. (2024). Phylogenomics and metabolic engineering reveal a conserved gene cluster in Solanaceae plants for withanolide biosynthesis. bioRxiv 2024.09.27.614867; doi: 10.1101/2024.09.27.614867.

• Choudhary N, Pucker B (2024) Conserved amino acid residues and gene expression patterns associated with the substrate preferences of the competing enzymes FLS and DFR. PLOS ONE 19(8): e0305837. doi: 10.1371/journal.pone.0305837.

• Rempel A., Choudhary N. and Pucker B. (2023). KIPEs3: Automatic annotation of biosynthesis pathways. PLOS ONE 18(11): e0294342. doi: 10.1371/journal.pone.0294342.
   

Stipendien und Auszeichnungen

• DAAD-Kospie-Stipendium
• HTRA-Stipendium