Der SFB 880 hat im Rahmen seiner Haushaltsführung nicht verausgabte sowie pauschal gewährte Mittel verwendet, um einerseits innovative Projektideen auf dem Gebiet „Grundlagen der Hochauftriebssysteme künftiger Verkehrsflugzeuge“ zu fördern, die bislang im SFB880 noch nicht bearbeitet wurden. Zum anderen sollte der Weg in wissenschaftliche Selbständigkeit von jungen Wissenschaftlern gefördert werden.
Hierfür wurden zunächst in der ersten und nun in der zweiten Förderperiode Ausschreibungen auf die Ausarbeitung von Projektideen in den Einrichtungen des SFB 880 durch Nachwuchswissenschaftler am Standort veröffentlicht. Die Anträge wurden nach vorher festgelegten, transparenten Bewertungskriterien vom Vorstand des SFB 880 beurteilt und so konnten in der ersten Förderperiode insgesamt 3 Projekte bewilligt werden:
Die drei Junior-Projekte der ersten Förderperiode des SFB 880 sind:
In der zweiten Förderperiode konnten folgende 2 Juniorprojekte bewilligt werden: