Bacillus subtilis

Regulationsnetzwerk der anaeroben Anpassung von Bacillus subtilis

Um die Anpassung von Bacillus subtilis an anaerobe Lebensbedingungen zu verstehen analysieren wir die Genexpression unter aeroben und anaeroben Wachstumsbedingungen und suchen nach den beteiligen Regulatoren. Das Zwei-Komponentensystem ResDE, der Redoxregulator Fnr und der transkriptionelle Modulator ArfM konnten bisher als Teil des Regulationsnetzwerks zur anaeroben Anpassung identifiziert werden. Neben der anaeroben Regulation konnten wir zeigen, dass in Anwesenheit von Nitrat die Gene der Nitratatmung stärker induziert werden und die Gene der Fermentation reprimiert werden.

Schwerpunkte der Arbeit:

• Funktionelle Charakterisierung und Strukturaufklärung des B. subtilis Fnr
• Identifizierung und Charakterisierung anaerob induzierter kleiner RNAs
• Mutagenese und funktionelle Analyse der ResE Histidinkinase
• Die heterologe Produktion und Kristallisation der DNA Bindedomäne des Regulators AlsR
• Analyse kleiner Proteine, die an der anaeroben Regulation beteiligt sind