Transcriptional regulatory network - from genetics to systems biology models
Das Bakterium Clostridioides difficile verursacht die C. difficile assoziierte Diarrhoe (CDAD). Diese ist eine der gefährlichsten im Krankenhaus erworbenen Infektionen. Jedes Jahr treten Hunderte, wenn nicht Tausende Fälle von CDAD auf.
Im Verbundprojekt "CDInfect" erforscht ein interdisziplinäres Forscherteam die wissenschaftlichen Grundlagen für die Entwicklung neuer Diagnostika und Therapien zur Behandlung von C. difficile-Infektionen.
In unserer Arbeitsgruppe untersuchen wir die genregulatorischen Netzwerke, involviert in verschiedenen Bereichen des Primär- und Sekundärmetabolismus. Im Rahmen dieser Studien wird unter anderem das Group II Intron basierte ClosTron mutagenesis- System (Heap, et al., 2007, Heap, et al., 2010) in unserem Labor etabliert, welches es ermöglicht gezielt beliebige Gene zu inaktivieren. Darüber hinaus sollen Fluoreszenz- markierte Reportergen- Systeme entwickelt werden, die es ermöglichen sollen zeitaufgelöste in vivo Analysen z.B. in Infektionsmodellen durchzuführen. Für eine bestmögliche Zusammenarbeit ist unsere Gruppe eng mit anderen Forschergruppen des Verbundprojekts von der Medizinischen Hochschule Hannover, der DSMZ, den Universitäten in Göttingen und Greifswald und dem Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung vernetzt.
Literatur:
Heap JT, Pennington OJ, Cartman ST, Carter GP & Minton NP (2007) The ClosTron: a universal gene knock-out system for the genus Clostridium. J Microbiol Methods 70: 452-464.
Heap JT, Kuehne SA, Ehsaan M, Cartman ST, Cooksley CM, Scott JC & Minton NP (2010) The ClosTron: Mutagenesis in Clostridium refined and streamlined. J Microbiol Methods 80: 49-55.
Elektronenmikroskopische Aufnahmen von Clostridium difficile (eingefärbt) (Manfred Rohde (2007), Helmholtz Zentrum für Infektionsforschung, Braunschweig).